پروتئین شیر حاوی 3/3 درصد پروتئین کل است. پروتئین‌های شیر حاوی 9 اسید آمینه ضروری مورد نیاز انسان است. پروتئین‌های شیر در غده پستانی سنتز می‌شوند، اما 60٪ از اسیدهای آمینه مورد استفاده در ساخت پروتئین‌ها از رژیم غذایی گاو به دست می‌آید. کل پروتئین شیر و ترکیب اسیدهای آمینه با نژاد گاو و ژنتیک حیوانات متفاوت است.استفاده از پودر های پریمیکس شده انواع پروتئین شیر در فرآورده های لبنی می تواند علاوه بر بهبود اثرات تغذیه ای می تواند خصوصیات بافتی و رئولوژیکی مناسبی را در فرآورده نهایی مد نظر ایجاد کند
